Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms