Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms