Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms