Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfkbiaQ9Z1E3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NfkbiaQ9Z1E3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms