Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rspo1Q9Z132 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rspo1Q9Z132 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rspo1Q9Z132 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rspo1Q9Z132 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms