Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp5Q9Z131 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Sh3bp5Q9Z131 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Sh3bp5Q9Z131 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Sh3bp5Q9Z131 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp5Q9Z131 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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