Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dctn3Q9Z0Y1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms