Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn10Q9Z0S6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn10Q9Z0S6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms