Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slit3Q9WVB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slit3Q9WVB4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms