Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp4Q9WV89 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms