Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apobec2Q9WV35 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms