Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp1a4Q9WV27 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp1a4Q9WV27 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms