Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ramp3Q9WUP1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms