Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opn3Q9WUK7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Opn3Q9WUK7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Opn3Q9WUK7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Opn3Q9WUK7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms