Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nrf1Q9WU00 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms