Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim3Q9R1R2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms