Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htra1Q9R118 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms