Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod2Q9R0B9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod2Q9R0B9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Plod2Q9R0B9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod2Q9R0B9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Plod2Q9R0B9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms