Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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