Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nubp1Q9R060 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms