Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col4a3Q9QZS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms