Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp21Q9QZL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp21Q9QZL6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp21Q9QZL6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms