Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ercc4Q9QZD4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms