Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc3Q9QZC1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc3Q9QZC1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms