Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo1Q9QZ11 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo1Q9QZ11 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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