Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms