Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd4Q9QY39 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd4Q9QY39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd4Q9QY39 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd4Q9QY39 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms