Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpsf3Q9QXK7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpsf3Q9QXK7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms