Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Limd1Q9QXD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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