Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim44Q9QXA7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms