Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krt17Q9QWL7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms