Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk1eQ9JMK2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms