Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sfmbt1Q9JMD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms