Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpc4apQ9JLV2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms