Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms