Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod4Q9JLH8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.3 ms