Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SacsQ9JLC8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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SacsQ9JLC8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SacsQ9JLC8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms