Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TefQ9JLC6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms