Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot9Q9JKY0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms