Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upk3aQ9JKX8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upk3aQ9JKX8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms