Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arl6ip1Q9JKW0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms