Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms