Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PigbQ9JJQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PigbQ9JJQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms