Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Caln1Q9JJG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caln1Q9JJG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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