Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riox1Q9JJF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms