Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzk1Q9JIL4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzk1Q9JIL4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzk1Q9JIL4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzk1Q9JIL4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzk1Q9JIL4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pdzk1Q9JIL4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzk1Q9JIL4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms