Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r2Q9JHL1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9a3r2Q9JHL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms