Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms