Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc28a3Q9ERH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms