Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slco1c1Q9ERB5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slco1c1Q9ERB5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slco1c1Q9ERB5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slco1c1Q9ERB5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms